Mikroorganisme menjadi salah satu faktor risiko IDO yang unik, sebab berbeda di tiap wilayah. Misalnya, Staphylococcus aureus dan Staphylococcus epidermidis yang paling umum berhubungan dengan IDO di berbagai negara, tapi di beberapa wilayah lain justru spesies E.coli, dan Pseudomonas aeruginosa yang paling terkait dengan IDO.
Mikroorganisme penyebab IDO yang berbeda di tiap wilayah, tentu saja membutuhkan panduan praktik klinis yang berbeda pula.